A discordância com relação ao papado e ao poder ilimitado atribuído ao papa foi causa de inúmeros cismas (separações) ocorridos no seio da Igreja. Esse assunto, além de atual, é o tema central de O Papa e o Concílio, escrito em 1869 mas ainda discutido, como aconteceu em outubro de 2001, no Sínodo (assembléia) convocado pelo papa João Paulo II. Obra dividida em 2 volumes, que seguem juntos, sendo o primeiro apenas a introdução feita pelo tradutor Rui Barbosa (e que se faz maior que o próprio livro).