A obra descreve as experiências de Ramatís, conhecido filósofo de Alexandria nos tempos de Jesus, que foi à Palestina encontrar pessoalmente o mestre Nazareno e, posteriormente, colheu os verdadeiros registros vivos da existência de Jesus no planeta. Apresenta com realismo a vida de Jesus na Terra: seu nascimento, a infância e seu lar, suas brincadeiras, preferências, família, a vida cotidiana entre o povo hebreu, o cenário da Galiléia e muito mais. Revela ainda detalhes sobre a figura de Maria de Nazaré: sua missão, a gestação protegida e o verdadeiro cenário de nascimento do menino-luz. Traça também o perfil de outras figuras que cruzaram o caminho de Cristo e relata o drama do calvário e seus últimos dias na vida física.
Mais do que o depoimento de uma cientista reconhecida no mundo inteiro por suas pesquisas sobre ondas cerebrais e estados alterados de consciência, O Rio Subterrâneo é um corajoso relato de aspectos subjetivos que marcaram a vida e a sensibilidade de Gilda Moura e que acabaram formando a psicanalista e pesquisadora, levando-a a ocupar o espaço que lhe cabe na comunidade científica internacional.